Para peneliti dari universitas Basel dan Zurich telah menggunakan spesimen historis dari koleksi medis UZH untuk memecahkan kode genom virus yang bertanggung jawab atas pandemi influenza 1918-1920 di Swiss. Bahan genetik virus mengungkapkan bahwa ia telah mengembangkan adaptasi kunci kepada manusia pada awal apa yang menjadi pandemi influenza paling mematikan dalam sejarah.
Epidemi virus baru menimbulkan tantangan besar bagi kesehatan masyarakat dan masyarakat. Memahami bagaimana virus berkembang dan belajar dari pandemi masa lalu sangat penting untuk mengembangkan penanggulangan yang ditargetkan. Flu Spanyol tahun 1918-1920 adalah salah satu pandemi paling dahsyat dalam sejarah, mengklaim sekitar 20 hingga 100 juta nyawa di seluruh dunia. Namun, sampai sekarang, sedikit yang diketahui tentang bagaimana virus influenza bermutasi dan diadaptasi selama pandemi.
Virus flu lebih dari 100 tahun diurutkan
Sebuah tim peneliti internasional yang dipimpin oleh Verena Schünemann, seorang paleogenetik dan profesor ilmu arkeologi di Universitas Basel (sebelumnya di University of Zurich) kini telah merekonstruksi genom Swiss pertama dari virus influenza yang bertanggung jawab atas pandemi 1918-1920. Untuk studi mereka, para peneliti menggunakan virus yang lebih dari 100 tahun yang diambil dari sampel spesimen basah yang ditahan formalin dalam koleksi medis Institute of Evolutionary Medicine di UZH. Virus itu berasal dari seorang pasien berusia 18 tahun dari Zurich yang telah meninggal selama gelombang pertama pandemi di Swiss dan menjalani otopsi pada Juli 1918.
“Ini adalah pertama kalinya kami memiliki akses ke genom influenza dari pandemi 1918-1920 di Swiss. Ini membuka wawasan baru tentang dinamika bagaimana virus diadaptasi di Eropa pada awal pandemi,” kata penulis terakhir Verena Schünemann. Dengan membandingkan genom Swiss dengan beberapa genom virus influenza yang sebelumnya diterbitkan dari Jerman dan Amerika Utara, para peneliti dapat menunjukkan bahwa strain Swiss sudah membawa tiga adaptasi utama kepada manusia yang akan bertahan dalam populasi virus sampai akhir pandemi.
Dua dari mutasi ini membuat virus lebih tahan terhadap komponen antivirus dalam sistem kekebalan manusia – penghalang penting terhadap transmisi virus flu seperti unggas dari hewan ke manusia. Mutasi ketiga menyangkut protein dalam membran virus yang meningkatkan kemampuannya untuk berikatan dengan reseptor dalam sel manusia, membuat virus lebih tangguh dan lebih menular.
Metode sekuensing genom baru
Tidak seperti adenovirus, yang menyebabkan pilek biasa dan terdiri dari DNA stabil, virus influenza membawa informasi genetik mereka dalam bentuk RNA, yang menurunkan lebih cepat. “RNA kuno hanya dipertahankan dalam waktu yang lama dalam kondisi yang sangat spesifik. Itulah sebabnya kami mengembangkan metode baru untuk meningkatkan kemampuan kami untuk memulihkan fragmen RNA kuno dari spesimen semacam itu,” kata Christian Urban, penulis pertama studi ini dari UZH. Metode baru ini sekarang dapat digunakan untuk merekonstruksi genom lebih lanjut dari virus RNA kuno dan memungkinkan para peneliti untuk memverifikasi keaslian fragmen RNA yang dipulihkan.
Untuk studi mereka, para peneliti bekerja sama dengan koleksi medis Uzh dan Museum Sejarah Medis Berlin dari Rumah Sakit Universitas Charité. “Koleksi medis adalah arsip yang tak ternilai untuk merekonstruksi genom virus RNA kuno. Namun, potensi spesimen ini masih kurang dimanfaatkan,” kata Frank Rühli, rekan penulis penelitian dan kepala Institute of Evolutionary Medicine di UZH.
Para peneliti percaya hasil penelitian mereka akan terbukti sangat penting dalam hal menangani pandemi masa depan. “Pemahaman yang lebih baik tentang dinamika bagaimana virus beradaptasi dengan manusia selama pandemi dalam jangka waktu yang lama memungkinkan kita untuk mengembangkan model untuk pandemi di masa depan,” kata Verena Schünemann. “Berkat pendekatan interdisipliner kami yang menggabungkan pola transmisi historis-epidemiologis dan genetik, kami dapat membangun fondasi berbasis bukti untuk perhitungan,” tambah Kaspar Staub, rekan penulis dari UZH. Ini akan membutuhkan rekonstruksi lebih lanjut dari genom virus serta analisis mendalam yang mencakup interval yang lebih lama.
literatur
Kristen Urban et at. Genom influenza kuno dari Swiss memungkinkan wawasan yang lebih dalam tentang adaptasi inang selama pandemi flu 1918 di Eropa. Biologi BMC. 1 Juli 2025. Doi: https://doi.org/10.1186/s12915-025-02282-z
