Pengurutan RNA Mammoth untuk pertama kalinya menandai lompatan besar menuju pemahaman kehidupan prasejarah
Untuk pertama kalinya, para ilmuwan berhasil mengurutkan RNA mammoth berbulu, mematahkan asumsi bahwa molekul genetik yang rapuh ini tidak dapat bertahan sejak dahulu kala.
RNA, atau asam ribonukleat, membawa instruksi antara DNA dan mesin pembuat protein suatu organisme, bertindak sebagai pembawa pesan untuk mengubah informasi genetik menjadi protein. RNA dapat mengungkapkan gen mana yang aktif dalam sel pada saat tertentu, serta bagaimana pola aktivitas gen dalam sel berubah seiring waktu. Dengan demikian, RNA purba dapat memberi informasi kepada para ilmuwan tentang keadaan seluler spesies yang punah.
Meskipun DNA memberikan cetak biru suatu organisme, ada batasan terhadap informasi yang diungkapkannya. RNA “membuka jendela tentang bagaimana” cetak biru tersebut diimplementasikan dalam setiap sel organisme, kata rekan penulis studi Zoë Pochonseorang mahasiswa doktoral di Universitas Stockholm.
Messenger RNA (mRNA) yang diberi nama tepat “adalah pembawa pesan DNA,” katanya kepada Live Science melalui email. Dengan kata lain, ia membawa salinan instruksi DNA dari nukleus ke sel. Bagian sel lainnya kemudian mengikuti instruksi ini, tambahnya.
Dalam studi baru, yang diterbitkan Jumat (14 November) di jurnal Selpara peneliti beralih ke 10 mammoth berbulu yang terpelihara dengan baik (mammoth primitif) spesimen dari Siberia yang berumur 10.000 hingga 50.000 tahun. Tim berharap kondisi beku dapat mengawetkan lebih banyak spesimen sehingga dapat memberikan hasil yang lebih baik.
Satu spesimen khususnya — Yukaseekor mamut remaja berwarna jahe — memberikan hasil yang spektakuler. Yuka berusia sekitar 39.000 tahun, menjadikannya urutan RNA tertua hingga saat ini. Sebelumnya, perbedaan tersebut dipegang oleh jaringan yang diambil sampelnya dari a jujur bertanggal sekitar 14.300 tahun.
Hebatnya, para ilmuwan menemukan sinyal genetik yang pasti bahwa Yuka, yang sebelumnya diyakini sebagai a perempuan berdasarkan ciri fisiknya, sebenarnya berjenis kelamin laki-laki.
Selain itu, RNA memberikan wawasan tentang fungsi otot Yuka – khususnya, RNA “menciptakan protein yang meregangkan dan mengontraksikan otot,” kata penulis utama studi tersebut. Emilio Marmol Sánchezyang bekerja di Pusat Hologenomik Evolusioner, Universitas Kopenhagen pada saat makalah ini dibuat. Tim tersebut “juga menemukan seluruh rangkaian gen pengatur,” katanya kepada Live Science.
Ketika sel mati, yang tertinggal adalah fungsi terakhir RNA. “Apa yang kami tangkap di sini, dalam arti tertentu, adalah cuplikan momen-momen terakhir kehidupan mamut ini” di dalam sel mereka, kata Mármol Sánchez.
Apa yang dilihat tim pada RNA otot Yuka mencerminkan potensi kengerian di saat-saat terakhirnya. Mármol Sánchez menjelaskan bahwa mereka menemukan “bukti molekuler dari stres sel metabolik di otot Yuka,” yang sesuai dengan apa yang dilakukan tim ilmiah terpisah. dijelaskan pada tahun 2021. Dalam penelitian tersebut, para peneliti mencatat banyak bekas cakaran yang mungkin dibuat oleh singa gua (Panthera spelaea), serta bekas gigitan predator kecil di tubuh dan ekor mamut. Namun apakah Yuka diburu dan dibunuh oleh predator besar atau hanya dimakan setelah mati tidak diketahui. Para peneliti tidak mengetahui apa yang menyebabkan stres sel yang diamati pada RNA.
Federico Sánchez Quintoseorang ahli paleogenomik di Laboratorium Internasional Penelitian Genom Manusia Universitas Otonomi Nasional Meksiko (UNAM) yang tidak terlibat dalam penelitian ini, menganggap ini sebagai “publikasi terobosan di bidang paleogenomik.” Dia menggambarkan penelitian ini sebagai “menarik karena mencapai sesuatu yang sebelumnya tidak terbayangkan, karena RNA sangat tidak stabil bahkan dalam kondisi yang menguntungkan.” Selain itu, “penelitian ini memperoleh RNA dari sampel yang lebih tua [than other recent RNA work]dalam jumlah yang lebih besar dan lebih pasti,” katanya kepada Live Science melalui email.
Temuan ini mengungkapkan bahwa ada kemungkinan untuk mengekstraksi RNA dari spesimen yang sangat tua dan menampilkan bidang studi baru yang potensial bagi peneliti lain, kata tim tersebut. Selain itu, tim telah menyertakan peta jalan untuk membantu orang lain agar berhasil memperoleh RNA kuno.
“Mampu memulihkan RNA dari sampel purba, selain DNA, seperti membuka jendela baru ke dalam biologi hewan yang punah,” rekan penulis studi tersebut. Cinta Dalénprofesor genetika evolusioner di Pusat Palaeogenetika di Universitas Stockholm, mengatakan kepada Live Science. “Ini adalah alat canggih lainnya yang memungkinkan kita melihat gen mana yang aktif dalam tipe sel berbeda, yang pada akhirnya dapat membantu kita lebih memahami gen mana yang membuat mamut menjadi mamut!”
